Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PCGF6Q9BYE7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms