Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SALL3Q9BXA9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SALL3Q9BXA9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms