Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLVAPQ9BX97 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLVAPQ9BX97 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLVAPQ9BX97 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLVAPQ9BX97 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLVAPQ9BX97 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLVAPQ9BX97 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLVAPQ9BX97 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLVAPQ9BX97 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms