Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS2Q9BVG9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms