Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAGR1Q9BTK6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms