Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
THUMPD2Q9BTF0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms