Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms