Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C2orf88Q9BSF0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms