Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD2Q9BSE4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms