Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms