Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGRRF1Q99675 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGRRF1Q99675 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms