Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD9AQ99638 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD9AQ99638 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms