Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EYA3Q99504 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms