Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NAP1L3Q99457 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms