Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YME1L1Q96TA2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms