Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms