Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK5RAP2Q96SN8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms