Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms