Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC9Q96Q05 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms