Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF558Q96NG5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF558Q96NG5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms