Protein–RNA interactions for Protein: Q96MM3

ZFP42, Zinc finger protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP42Q96MM3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFP42Q96MM3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms