Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
C8orf48Q96LL4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf48Q96LL4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms