Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM87BQ96K49 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms