Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms