Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDX27Q96GQ7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX27Q96GQ7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms