Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC97Q96F63 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms