Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIFAQ96CG3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIFAQ96CG3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms