Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYTL4Q96C24 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms