Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms