Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC35C1Q96A29 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35C1Q96A29 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms