Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCE1Q969G3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms