Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms