Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP9XQ93008 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms