Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4BQ92750 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4BQ92750 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms