Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC1Q92574 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC1Q92574 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms