Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
TOPBP1Q92547 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TOPBP1Q92547 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms