Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA4

GTF3C2, General transcription factor 3C polypeptide 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2Q8WUA4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF3C2Q8WUA4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms