Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMO3Q8TAP4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms