Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYRIPQ8NFW9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms