Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC148Q8NFR7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms