Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC9Q8NEP7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC9Q8NEP7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms