Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM7

SUPT20H, Transcription factor SPT20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20HQ8NEM7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUPT20HQ8NEM7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUPT20HQ8NEM7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUPT20HQ8NEM7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUPT20HQ8NEM7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUPT20HQ8NEM7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUPT20HQ8NEM7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUPT20HQ8NEM7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUPT20HQ8NEM7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUPT20HQ8NEM7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUPT20HQ8NEM7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUPT20HQ8NEM7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SUPT20HQ8NEM7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SUPT20HQ8NEM7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUPT20HQ8NEM7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms