Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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