Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG8Q8ND04 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms