Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDPRQ8NCN5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms