Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD1Q8NBU5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATAD1Q8NBU5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms