Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DTX3Q8N9I9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DTX3Q8N9I9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms