Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms