Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF182Q8N6D2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms