Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VWDEQ8N2E2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VWDEQ8N2E2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms